L’ecografia morfologica è uno screening ecografico importante consigliato a tutte le gravide nel II trimestre della gestazione daeseguire  tra la 19ma e la 21ma settimana. In tale periodo il feto è sufficientemente grande per permettere di valutare la regolare morfologia e la funzione degli organi. Vengono sistematicamente esaminati la testa, la conformazione dello scheletro (teca cranica, colonna vertebrale, cassa toracica, bacino ed arti) e gli organi (encefalo, polmoni, cuore, intestino, stomaco, reni, parete addominale, cordone ombelicale, genitali) ecc..